方舟子则表示：“青蒿素是在对数千种中草药进行复查的基础上发现的，仅仅在这个意义上，它和中医药有一点点关系，而实际上它的发现和中医药没有太大的关系。”他在2011年曾发表文章评论青蒿素的发现，指青蒿素是采用化学方法提取的植物药，灵感来自中医药典，但“其实青蒿素不是中药”。
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