《口袋妖怪黑2》是由GAME FREAK制作的一款策略类角色扮演游戏，是口袋妖怪系列第五世代正统续，而作为《口袋妖怪黑白》的续作——《口袋妖怪黑白2》在前作的基础进行了大幅的调整，游戏性能进一步提升。游戏故事发生在2年后伊修地区的新故事。虽然游戏的舞台一样，但城市的设施、登场的角色都不尽相同，而且还会追加新的口袋妖怪。此外，本作还加强了通信联机方面的要素，例如支持百人进行通信等

玩家同劲敌自合众地方的西侧桧扇市开始旅行，自白露处领取他们的初学者口袋妖怪。与其他口袋妖怪主系列游戏相同，玩家游历整个地区，挑战道馆训练家们以集齐八个道馆徽章，并前往挑战联盟的四天王与冠军。游戏的剧情再次引入了电浆团。电浆团的成员在玩家、劲敌和新任道馆训练家霍米加面前宣布了自己掌控世界的计划并抢走了他人的口袋妖怪。在艾莉丝的督促下，玩家帮助亚堤追踪电浆团成员，并邂逅了专注于研究神奇宝贝隐藏的力量和才能的阿克罗玛。在不断对抗电浆团并收集道馆徽章的过程中，玩家追踪电浆团成员来到了最后一个道馆的所在地青海波市，在道馆训练家西子伊的帮助下救出了被电浆团控制的酋雷姆。战斗在青海波市毗邻的巨人洞穴进入了白热化阶段，玩家击败了电浆团首领魁奇思控制的暗黑酋雷姆（黑2）/焰白酋雷姆（白2）。一意孤行的魁奇思无法接受自己再次被挫败（首次发生在黑白中）的事实，没有听从N的劝说离开。后者感谢了玩家一劳永逸地消灭了电浆团。玩家随后挑战了四天王和新任联盟冠军艾莉丝，最终通关。

在游戏的主线剧情完成后，玩家还可以来到N的城堡，了解N的过去。在战胜N后，N会引导玩家收服先前N拥有的传说中的神奇宝贝。

共平（キョウヘイ）和小鸣（メイ）

与黑白版不同的主人公。来自桧扇市的少年，在游戏的开始中会跟童年好友兼劲敌阿相一起从此开展旅程。

阿相（ヒュウ）

主人公的童年好友，热衷于神奇宝贝对战和变强，十分疼爱妹妹。

N（N）

电浆团的王。最初的电浆团团员均听从N的号令，却也不知道N的下落。

艾莉丝（アイリス）

艾莉丝在黑白版中首次登场。在黑白2中，艾莉丝成为了联盟冠军，手持的口袋妖怪实力强劲。

魁奇思（ゲーチス）

黑白版中暗中操纵N，妄图带领电浆团征服世界。被挫败2年后，掌控着传说中的龙口袋妖怪的他野心未减，蠢蠢欲动。

暗黑酋雷姆（ブラックキュレム）

暗黑酋雷姆是酋雷姆与捷克罗姆合体的型态，是龙系和冰系神奇宝贝。特性兆级电压，使用技能时不受目标特性影响。身高3.3m，体重325kg，专用技能为冻结伏特。

焰白酋雷姆（ホワイトキュレム）

焰白酋雷姆是酋雷姆与雷希拉姆合体的型态，是龙系和冰系神奇宝贝。特性涡轮高温，使用技能时不受目标特性影响。身高3.6m，体重325kg，专用技能为寒冷闪光。